L'Église presbytérienne des États-Unis est restructurée et le COEMAR est dissout. Le Centre John Knox est en péril sans son soutien financier, mais la force et la détermination de la communauté reposent sur un nouveau modèle qui constitue la base des activités actuelles du Centre: installations de conférence, chambres et services de restauration accessibles à tous.
Grâce à l’initiative du révérend Edmond Perret, secrétaire général de l’Alliance réformée mondiale, le Centre est géré pendant un an, sans soutien financier ni responsabilité vis-à-vis de la dette.
La clientèle initialement composée d’étudiants et de groupes religieux s’agrandit rapidement de manière à englober les communautés locales et internationales de Genève, des groupes humanitaires et éducatifs, des organisations non gouvernementales et intergouvernementales.